Giải vô địch bóng đá nữ U16 châu Á bắt đầu từ năm 2005 dưới cái tên AFC U-17 Women's Championship. Tới năm 2019, AFC quyết định thay đổi độ tuổi tham dự từ U17 xuống U16 nhằm đồng bộ với quý định của FIFA cho giải U17 World Cup nữ. Sự thay đổi này nhấn mạnh cam kết của AFC trong việc bòi dưỡng tài năng từ nhữ nhất, chuẩn bị cho các vận động viên trẻ đạt đến các sân chơi lớn hơn.Từ đó đến nay, giải đấu được tổ chức hai năm